Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptpn9O35239 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn9O35239 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms