Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smad6O35182 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms