Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms