Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PbsnO08976 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PbsnO08976 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PbsnO08976 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PbsnO08976 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PbsnO08976 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PbsnO08976 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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PbsnO08976 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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PbsnO08976 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PbsnO08976 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PbsnO08976 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PbsnO08976 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms