Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Eftud2O08810 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms