Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkcshO08795 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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