Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BC117090L7N257 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms