Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms