Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm5294J3QP53 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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