Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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