Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm21411J3KMS0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21411J3KMS0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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