Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm20828J3KMI7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gm20828J3KMI7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20828J3KMI7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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