Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp408H7BX78 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp408H7BX78 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp408H7BX78 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp408H7BX78 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp408H7BX78 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp408H7BX78 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Zfp408H7BX78 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp408H7BX78 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp408H7BX78 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp408H7BX78 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp408H7BX78 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Zfp408H7BX78 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp408H7BX78 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Zfp408H7BX78 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp408H7BX78 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp408H7BX78 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp408H7BX78 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp408H7BX78 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp408H7BX78 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp408H7BX78 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Zfp408H7BX78 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Zfp408H7BX78 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Zfp408H7BX78 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Zfp408H7BX78 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Zfp408H7BX78 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfp408H7BX78 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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