Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Taf4bG5E8Z2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Taf4bG5E8Z2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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