Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vmn1r67G5E8C1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms