Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28048F7BCN0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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