Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lmod3E9QA62 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmod3E9QA62 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms