Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ccdc71lE9Q4T4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ccdc71lE9Q4T4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ccdc71lE9Q4T4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ccdc71lE9Q4T4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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