Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms