Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc1E9Q043 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms