Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Srp54bE9PXC0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms