Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc8E9PWG2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc8E9PWG2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms