Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3002E9PW72 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm3002E9PW72 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms