Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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