Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2B9EJA2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2B9EJA2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms