Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Phf11bB4XVQ1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms