Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia1B2RXQ2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia1B2RXQ2 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia1B2RXQ2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia1B2RXQ2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia1B2RXQ2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia1B2RXQ2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia1B2RXQ2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia1B2RXQ2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia1B2RXQ2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia1B2RXQ2 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia1B2RXQ2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia1B2RXQ2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia1B2RXQ2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia1B2RXQ2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia1B2RXQ2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppfia1B2RXQ2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms