Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cspp1B2RX88 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms