Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usf3B2RUQ2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms