Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf3B2RQG2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf3B2RQG2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms