Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NhsB1AV60 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms