Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Grik3B1AS29 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms