Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-M5A7VMS3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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