Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm6880A3KG45 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm6880A3KG45 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm6880A3KG45 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm6880A3KG45 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm6880A3KG45 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm6880A3KG45 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm6880A3KG45 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm6880A3KG45 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm6880A3KG45 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm6880A3KG45 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm6880A3KG45 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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