Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rtf1A2AQ19 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rtf1A2AQ19 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rtf1A2AQ19 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rtf1A2AQ19 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rtf1A2AQ19 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rtf1A2AQ19 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rtf1A2AQ19 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms