Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lcn6A2AJB9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms