Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms