Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrit3W8DXL4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrit3W8DXL4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms