Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm5114W4VSN8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm5114W4VSN8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5114W4VSN8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms