Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3550W4VSN7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms