Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gria3Q9Z2W9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gria3Q9Z2W9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms