Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac6Q9Z2V5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac6Q9Z2V5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac6Q9Z2V5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Hdac6Q9Z2V5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac6Q9Z2V5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac6Q9Z2V5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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