Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trip6Q9Z1Y4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Trip6Q9Z1Y4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trip6Q9Z1Y4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms