Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NgfrQ9Z0W1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NgfrQ9Z0W1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NgfrQ9Z0W1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms