Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp1a4Q9WV27 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1a4Q9WV27 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms