Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim10Q9WUH5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms