Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfsf13bQ9WU72 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnfsf13bQ9WU72 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms