Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vax2Q9WTP9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vax2Q9WTP9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vax2Q9WTP9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms