Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Opn4Q9QXZ9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn4Q9QXZ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn4Q9QXZ9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms