Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnip3Q9QXT8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms